以下是对农村二层自建房的书房装修费用进行分析的几个角度：

1. 装修风格：书房的装修风格会影响到装修费用。不同的装修风格，如简约、欧式、中式等，所需要的材料、工艺和人工费用都有所不同。一般来说，简约风格的书房装修费用相对较低，而欧式和中式风格的书房装修费用相对较高。

2. 装修材料：书房装修所使用的材料也会影响到装修费用。例如，地板、墙面、天花板、门窗等材料的质量、品牌、价格等都会对装修费用产生影响。一般来说，选用高质量、品牌知名度高的装修材料，装修费用会相应增加。

3. 书房面积：书房的面积大小也是影响装修费用的因素之一。一般来说，面积越大，装修费用也会相应增加。

4. 地区差异：不同地区的装修费用也会有所不同。一般来说，一线城市的装修费用相对较高，而二、三线城市的装修费用相对较低。

基于以上因素，农村二层自建房的书房装修费用具体要多少钱，需要根据实际情况进行估算。一般来说，简约风格的书房装修费用大约在每平米 500-1000 元左右，欧式和中式风格的书房装修费用大约在每平米 1000-2000 元左右。如果书房面积较大，装修费用可能会更高。此外，具体的装修费用还会受到装修材料、人工费用、地区差异等因素的影响。

需要注意的是，以上费用仅供参考，实际装修费用可能会有所出入，建议在装修前咨询专业的装修公司或设计师，以获得更准确的估算。同时，在装修过程中，要注意控制预算，避免超支。