两房改三房的最佳方案需要根据房屋的具体情况和居住需求来确定。以下是一些可能需要考虑的因素和建议：

1. 空间利用：在两房改三房的过程中，需要尽可能地利用现有空间，同时保持房屋的舒适性和美观性。可以考虑将一些公共区域，如客厅或餐厅，分割成两个独立的空间，或者利用阳台、走廊等空间来增加房间数量。

2. 功能需求：需要考虑每个房间的功能需求，如卧室、书房、儿童房等。在设计方案时，需要确保每个房间都有足够的空间和功能，以满足居住者的需求。

3. 装修成本：装修成本也是需要考虑的因素之一。在确定方案时，需要考虑装修材料、人工费用等方面的成本，以确保装修预算在可承受范围内。

4. 房屋结构：房屋结构也是需要考虑的因素之一。在进行改造时，需要确保不会破坏房屋的承重结构，以保证房屋的安全和稳定性。

5. 采光和通风：采光和通风也是需要考虑的因素之一。在设计方案时，需要确保每个房间都有足够的采光和通风，以保证居住者的舒适度。

综上所述，两房改三房的最佳方案需要综合考虑空间利用、功能需求、装修成本、房屋结构和采光通风等多个因素。建议在进行改造前，先咨询专业的装修公司或设计师，以确保方案的可行性和安全性。