在房屋装修中，如果发现屋顶有窟窿，可以使用腻子来填补。以下是补顶窟窿的步骤：

清理表面：确保屋顶表面干净，没有尘土和杂物。如果有需要，可以使用砂纸或者刮刀将表面打磨平整。

准备腻子材料：购买合适的腻子材料，确保它与屋顶的材质相容。如果屋顶是水泥的，选择水泥基的腻子；如果是木头的，选择木材专用的腻子。

调制腻子：将适量的腻子粉与水混合，调制出适合填补的稠度。调制时要慢慢加水，并搅拌均匀，直到腻子达到理想的稠度。

填补窟窿：使用刮刀或者抹刀将调制好的腻子填入窟窿中。注意要填满整个窟窿，并稍微高出周围表面一些。

等待干燥：让腻子自然干燥，时间因材料和天气而异。通常需要等待24小时以上，以确保腻子完全固化。

打磨表面：等腻子完全干燥后，使用砂纸或者砂轮将表面打磨平整，使填补处与周围表面平滑过渡。

上漆：如果需要，可以在打磨平整后涂上屋顶涂料，使填补处与周围一致。

通过以上步骤，就可以用腻子填补屋顶的窟窿了。需要注意的是，不同材料和情况的屋顶可能需要不同的处理方法，最好请教专业人员或装修师傅的建议。