对于农村自建二层房中儿童房的设计，可以从以下几个角度进行分析：

1. 安全防护：儿童房的设计首先要考虑安全问题。房间内应该避免使用尖锐的家具和装饰品，如玻璃制的摆件、带有锐角的桌椅等。同时，地面应该平整防滑，墙面也要进行适当的软包处理，以避免儿童碰撞受伤。另外，电源开关、插座等也要安装在儿童无法触及的高度，以防止儿童误触。

2. 空间布局：儿童房的空间布局也非常重要。房间应该尽量宽敞明亮，有利于儿童的活动和成长。同时，家具的摆放也要注意留出足够的活动空间，避免儿童在玩耍时发生碰撞或者被家具绊倒等情况。

3. 色彩搭配：儿童房的色彩搭配应该明亮欢快，有利于儿童的心理健康。可以选择一些鲜艳的颜色，如红色、黄色、蓝色等，但是也要注意色彩的搭配不要过于花哨，以避免影响儿童的注意力和睡眠质量。

4. 环保材料：儿童房的装修材料应该选择环保、健康的产品。墙面涂料、地板、家具等都应该选择符合国家环保标准的材料，以避免甲醛、苯等有害物质对儿童身体的危害。

5. 通风透气：儿童房的通风透气也非常重要。应该尽量选择通风良好的房间作为儿童房，并安装适当的通风设备，如窗户、换气扇等，以保证房间内的空气流通，减少室内污染。

综上所述，设计一个安全的儿童房需要从多个角度进行考虑和分析，包括安全防护、空间布局、色彩搭配、环保材料和通风透气等方面。只有全面考虑，才能为儿童提供一个安全、舒适、健康的成长环境。