在农村自建二层楼房的装修过程中，需要特别注意以下安全问题：

1. 结构安全：在装修过程中，应避免对房屋的承重结构进行改造，如拆除承重墙、梁柱等。如果必须进行改造，应该先咨询专业的结构工程师，并按照其指示进行施工。

2. 防火安全：农村房屋通常是木质结构，而且装修过程中会使用到大量的木材、油漆、胶水等易燃材料，因此需要注意防火安全。应该选择符合防火标准的装修材料，并在施工现场配备灭火器等消防设备。

3. 用电安全：在装修过程中，需要安装电线和电器设备，应该选择符合国家标准的电线和电器设备，并请专业电工进行安装和调试。同时，还需要注意用电负荷，避免超负荷用电导致安全事故。

4. 高处作业安全：在二层楼房的装修过程中，会涉及到高处作业，如安装门窗、铺设地板等。在高处作业时，需要佩戴安全带等防护设备，并确保脚手架、梯子等设备的安全可靠。

5. 装修材料安全：选择装修材料时，需要注意材料的环保性和安全性。应该选择符合国家标准的装修材料，避免使用含有有害物质的材料，以保障居住者的身体健康。

6. 施工安全：在装修过程中，需要注意施工安全。应该按照规范的施工流程进行施工，避免违规操作导致安全事故。同时，还需要注意施工现场的安全管理，避免无关人员进入施工现场。

7. 防水安全：农村房屋通常是木质结构，而且通常是平房，容易受到雨水的侵蚀。在装修过程中，需要注意防水安全，应该选择防水性能较好的装修材料，并做好屋顶、门窗等部位的防水处理。

总之，在农村自建二层楼房的装修过程中，需要特别注意安全问题，从结构安全、防火安全、用电安全、高处作业安全、装修材料安全、施工安全和防水安全等多个方面进行考虑和防范，以确保装修过程的安全和顺利进行。