以下是对农村简约三层装修中门窗设计的一些建议：

1. 安全性：门窗是家居安全的重要防线，因此在设计时需要优先考虑安全性。选择高质量的门窗材料，确保其具有足够的强度和耐久性。在安装门窗时，要注意密封性和牢固性，避免出现漏风、渗水或者门窗脱落等问题。另外，可以考虑安装防盗门窗等安全设备，提高家居的安全性。

2. 实用性：门窗的设计应该符合农村简约的装修风格，同时也要考虑其实用性。例如，可以选择推拉式或者平开式的门窗，方便日常的开关使用。在门窗的尺寸设计上，要根据房间的大小和需要进行合理的规划，确保门窗能够满足通风、采光、隔音等多种需求。

3. 美观性：门窗是家居装修中的重要组成部分，其设计也需要考虑到美观性。在选择门窗的颜色和材质时，要与整体装修风格相协调。例如，可以选择简约的白色或者黑色铝合金门窗，或者木质门窗等，来营造出自然、温馨的家居氛围。

4. 节能性：在农村简约三层装修中，门窗的设计也需要考虑到节能性。可以选择具有良好密封性的门窗，减少室内外的热量交换，从而达到节能的效果。另外，可以选择安装太阳能门窗等节能设备，进一步降低能源的消耗。

5. 成本效益：在设计门窗时，需要考虑其成本效益。选择高质量、耐用的门窗材料，虽然初期投入可能较高，但是长期来看，能够节约维修和更换的成本。另外，可以根据装修预算合理控制门窗的尺寸和材质，以达到最佳的成本效益。

综上所述，农村简约三层装修中的门窗设计需要综合考虑安全性、实用性、美观性、节能性和成本效益等多个方面。在选择门窗材料和设计时，需要根据具体的情况进行合理的规划和决策，以达到最佳的装修效果。