对于农村自建房二层楼最新款的装修后如何通风去除甲醛这个问题，可以从以下几个角度进行分析：

1. 通风方式：在农村自建房中，可以采用自然通风和机械通风两种方式来去除甲醛。自然通风是通过开窗、开门等方式让空气流通，从而带走室内的甲醛；机械通风则是利用风机、管道等设备来加速空气流通，以达到更好的通风效果。

2. 通风时间：通风时间的长短对去除甲醛的效果有着重要的影响。一般来说，在装修完成后的前几天应尽量保持门窗打开，让室内外空气充分流通。在之后的日子里，也应该经常开窗通风，特别是在气温高、风力大的天气里，更要加强通风。

3. 甲醛来源：农村自建房的甲醛来源主要有两个方面，一是装修材料，如人造板材、油漆、涂料等；二是家居用品，如沙发、床垫、窗帘等。在选择装修材料和家居用品时，应尽量选择环保、低甲醛的产品，从源头上减少甲醛的释放。

4. 辅助措施：除了通风外，还可以采取一些辅助措施来去除甲醛，如放置活性炭、绿色植物、空气净化器等。这些物品可以吸附、分解甲醛，从而达到更好的除甲醛效果。

总之，农村自建房二层楼最新款的装修后，去除甲醛的通风方法主要包括自然通风和机械通风两种方式，通风时间越长越好，同时还需要注意甲醛的来源，尽量选择环保、低甲醛的装修材料和家居用品，并采取一些辅助措施来加强除甲醛效果。