在农村二层自建房别墅中，设计一个实用的厨房需要考虑以下几个方面：

1. 空间布局：厨房的空间布局应该根据别墅的整体布局和家庭的生活习惯来确定。通常，厨房应该紧邻餐厅，方便用餐。同时，要考虑厨房的面积，确保有足够的操作台面和储物空间。

2. 通风：厨房需要良好的通风，以避免油烟和异味积聚。可以在厨房内设置窗户或通风口，或者安装排气扇等设备。

3. 照明：足够的照明可以让厨房更加明亮，方便操作。在设计照明时，需要考虑到不同区域的照明需求，如操作台、洗涤区和储物区等。

4. 水电布局：厨房需要有足够的水电供应，以满足各种电器设备的使用需求。在设计水电布局时，需要考虑到插座的数量和位置，以及水管的走向和水龙头的位置。

5. 橱柜：橱柜是厨房中重要的储物空间，需要根据厨房的大小和家庭的需求来选择合适的橱柜。橱柜的颜色和材质应该与别墅的整体风格相协调。

6. 地面和墙面：厨房的地面和墙面应该选择易于清洁的材质，如瓷砖或石材。颜色应该选择深色系，以避免油污渗入。

7. 厨房设备：根据家庭的需求，选择合适的厨房设备，如炉灶、抽油烟机、冰箱、洗碗机等。设备的尺寸和功率应该与厨房的设计相匹配。

8. 安全隐患：厨房是一个容易发生安全事故的区域，需要注意安全隐患。在设计时，需要考虑到各种安全问题，如电器设备的漏电保护、燃气管道的泄漏检测、水龙头的漏水保护等。

9. 清洁卫生：厨房的清洁卫生非常重要，在设计时需要考虑到清洁的便利性。可以在厨房内设置垃圾桶、垃圾处理器等设备，方便垃圾的处理。

10. 风格统一：厨房的设计应该与别墅的整体风格相协调，以确保整个别墅的装修风格统一。

综上所述，设计一个实用的厨房需要综合考虑空间布局、通风、照明、水电布局、橱柜、地面和墙面、厨房设备、安全隐患、清洁卫生和风格统一等多个方面。只有在这些方面都考虑周全，才能设计出一个美观、实用、安全的厨房。