对于农村二层双拼自建房的卧室装修，需要考虑以下几个因素：

1. 空间布局：卧室的空间布局应该合理，保证足够的睡眠和活动空间。同时，应该考虑到家具的摆放位置，以及床、衣柜、梳妆台等家具的尺寸，以确保卧室不会显得拥挤。

2. 照明设计：良好的照明设计可以营造舒适的卧室氛围。应该考虑到床头灯、顶灯、壁灯等不同类型的照明，并根据需要设置开关控制。此外，还应该考虑到自然光的利用，例如通过窗户或窗帘来调节室内光线。

3. 墙面和地面材料：卧室的墙面和地面材料应该选择舒适、安静的材质。例如，可以选择木地板或地毯来代替瓷砖，以增加卧室的温暖感。墙面材料可以选择涂料、墙纸或壁布等，颜色应该选择柔和、温馨的色调。

4. 隔音效果：在农村，可能会有噪音的干扰。因此，在卧室装修时，应该考虑到隔音效果，选择隔音性能较好的材料，例如在墙壁中加入隔音材料，或者选择具有隔音功能的门窗。

5. 窗帘和窗户：窗帘和窗户是卧室装修中不可忽视的部分。窗帘应该选择遮光性好、透气性好的材质，以保证睡眠质量。窗户应该选择密封性好、保温性能好的材质，以提高卧室的舒适度。

6. 空调和暖气：在寒冷的冬季和炎热的夏季，空调和暖气是保证卧室舒适度的关键。在装修时，应该考虑到空调和暖气的安装位置和管道铺设，并确保空调和暖气的效果良好。

7. 储物空间：卧室中需要存放衣物、床上用品等物品，因此在装修时应该考虑到足够的储物空间。可以选择衣柜、床头柜、梳妆台等家具来增加储物空间，同时还应该考虑到储物空间的实用性和方便性。

8. 安全问题：在卧室装修中，安全问题也不容忽视。应该选择符合安全标准的材料和家具，并在装修过程中注意电路、水路等方面的安全问题。此外，还应该考虑到卧室的防盗问题，例如安装防盗门窗等。

综上所述，农村二层双拼自建房的卧室装修需要考虑空间布局、照明设计、墙面和地面材料、隔音效果、窗帘和窗户、空调和暖气、储物空间以及安全问题等多个因素，以确保卧室的舒适度和安全性。