在新中式农村二层小别墅中，窗帘的选择应该考虑以下几个因素：

1. 风格搭配：窗帘的风格要与别墅的整体装修风格相协调。新中式风格强调简约、自然和优雅，窗帘的选择应该符合这些特点。可以选择素色的窗帘，或者在上面添加中式元素的图案或纹样，比如中式花鸟、山水画等。

2. 功能需求：窗帘的选择要根据不同的功能空间来考虑。比如，客厅和卧室需要考虑私密性和遮光性，可以选择两层窗帘，一层薄纱一层厚实的窗帘。而书房和餐厅则可以选择透光性较好的窗帘，以保证光线充足。

3. 材质选择：窗帘的材质也是需要考虑的重要因素。窗帘的材质应该与别墅的装修材质相匹配，比如可以选择丝绸、棉麻、涤纶等材质。同时，还要考虑材质的耐用性和易清洁性，以方便日后的维护。

4. 色彩搭配：窗帘的色彩要与别墅的整体色调相协调。一般来说，窗帘的颜色应该比墙面和地面的颜色深一些，以增加空间的层次感。同时，窗帘的颜色也应该与家具、灯具等软装的颜色相呼应，以达到整体搭配的效果。

5. 空间大小：窗帘的选择也要根据空间的大小来考虑。对于空间较大的房间，可以选择长款的窗帘，以增加空间的视觉延伸感。而对于空间较小的房间，则可以选择短款的窗帘，以避免空间显得压抑。

6. 价格预算：窗帘的价格差异较大，选择时要根据自己的预算来选择合适的窗帘。在预算范围内，可以选择材质好、款式新颖、色彩搭配协调的窗帘，以达到最佳的装修效果。

综上所述，在新中式农村二层小别墅中，窗帘的选择应该综合考虑风格搭配、功能需求、材质选择、色彩搭配、空间大小和价格预算等多个因素，以达到最佳的装修效果。