需要注意的问题主要包括以下几个方面：

结构安全：在进行改造之前，需要了解房屋的结构和承重情况，确保改造后的结构安全。

楼板打通：如果想要将楼上楼下打通，需要将楼板打通。在打通楼板的过程中，需要注意以下几点：

确保楼板的承重能力：在打通楼板时，需要考虑到楼板的承重能力，避免因增加重量而导致的安全问题。

做好隔音措施：楼上楼下打通后，楼下将成为主要的活动区域，需要做好隔音措施，以免对楼上住户造成干扰。

考虑楼板的防水问题：在打通楼板时，需要注意楼板的防水问题，避免出现漏水的情况。

空间布局：楼上楼下打通后，需要重新进行空间布局。布局时，需要考虑功能分区、采光、通风等因素，使改造后的空间既美观又实用。

装修质量：改造后的复式公寓需要进行装修，需要注意装修质量。选择合适的材料和工艺，确保装修质量和安全性。

法律法规：在进行改造之前，需要了解相关的法律法规和规定，确保改造行为合法合规。