农村自建房内部装修卫生间的设计需要考虑以下几个方面：

1. 空间布局：卫生间的空间大小决定了其布局方式。如果空间较大，可以考虑设置浴缸、淋浴房、洗手台、马桶等多种设施；如果空间较小，则需要合理安排各种设施的位置，以确保使用方便。

2. 给排水系统：卫生间的给排水系统是卫生间设计的重要组成部分。需要考虑卫生间的排水方式，是下排水还是侧排水，以及排水管道的直径和长度等问题。同时，还需要考虑卫生间的给水方式，是自来水还是井水，以及给水管道的直径和长度等问题。

3. 通风系统：卫生间是一个相对潮湿的空间，通风系统非常重要。需要考虑卫生间的通风方式，是自然通风还是机械通风，以及通风管道的直径和长度等问题。

4. 电力系统：卫生间需要安装适当的照明设施和插座，以方便使用。需要考虑电力系统的安全性，如使用防漏电保护开关等。

5. 装饰材料：卫生间的装饰材料需要考虑防水、防滑、易清洁等特性。例如，可以选择瓷砖、大理石等防水材料作为地面和墙面的装饰材料。

6. 卫生间的使用需求：不同家庭的卫生间使用需求不同，例如，有的家庭需要设置洗衣机，有的家庭需要设置婴儿浴盆等。需要根据家庭的实际需求来进行设计。

总之，农村自建房内部装修卫生间的设计需要综合考虑空间布局、给排水系统、通风系统、电力系统、装饰材料以及卫生间的使用需求等多个方面，以确保卫生间的使用方便、安全、舒适。