小复式上下两层的卫生间布局需要考虑以下几个方面：

1. 卫生间的数量：首先需要确定上下两层需要几个卫生间，以及每个卫生间的具体功能。如果住户较多或者有客人留宿，可能需要在楼上和楼下分别设置卫生间。如果只有一家三口居住，则可以考虑只在楼下设置一个卫生间。卫生间的数量和功能将直接影响到布局的设计。

2. 卫生间的位置：卫生间的位置应该尽量方便使用，并且要考虑到管道的布局。一般来说，楼下的卫生间应该靠近厨房和客厅，而楼上的卫生间则应该靠近卧室。同时，卫生间的位置还应该考虑到管道的长度和坡度，以确保排水顺畅。

3. 卫生间的布局：卫生间的布局应该根据卫生间的大小和形状来确定。一般来说，卫生间需要设置洗手盆、马桶、淋浴间或浴缸等设施。在布局时，需要充分考虑到各个设施的尺寸和位置，以确保使用方便并且不拥挤。

4. 卫生间的通风：卫生间是一个相对潮湿的地方，通风非常重要。在布局时，需要考虑到卫生间的通风问题，例如是否有窗户、是否需要安装排气扇等。

5. 卫生间的防水：卫生间的防水非常重要，因为一旦出现渗漏，将对楼下住户造成很大的影响。在布局时，需要考虑到卫生间的防水问题，例如地面和墙面的防水处理、管道的密封等。

6. 卫生间的收纳：卫生间的收纳也是一个需要考虑的问题。卫生间需要存放各种卫生用品和洗涤用品，在布局时需要考虑到收纳空间的设置，例如在洗手盆下方设置储物柜、在墙上设置置物架等。

综上所述，小复式上下两层的卫生间布局需要综合考虑多个因素，包括卫生间的数量、位置、布局、通风、防水和收纳等方面。在设计布局时，需要充分考虑住户的需求和使用习惯，以确保卫生间的使用方便、舒适、安全。