农村简约三层装修的卫生间设计需要考虑以下几个方面：

1. 空间布局：卫生间的空间大小应该根据房屋整体布局和居住需求来确定。一般来说，卫生间需要包括洗手盆、马桶、淋浴区和储物空间等基本功能区域。在空间有限的情况下，可以考虑采用壁挂式马桶、洗手盆等节省空间的设计。

2. 地面和墙面：卫生间的地面和墙面需要采用防水材料，以防止渗漏。同时，地面需要有一定的倾斜度，以便排水。在墙面设计上，可以选择明亮的瓷砖或防水涂料，以增加卫生间的明亮度和整洁感。

3. 通风和采光：卫生间需要有良好的通风和采光，以保证空气流通和减少潮湿感。可以在卫生间设置窗户或通风口，并选用明亮的灯光来增加卫生间的采光。

4. 给排水：卫生间的给排水系统需要设计合理，以确保排水顺畅和供水充足。需要根据卫生间的布局选择合适的水管和排水管，并确保水管的密封性和牢固性。

5. 浴室设备：卫生间需要配置必要的浴室设备，如洗手盆、马桶、淋浴喷头等。在选择浴室设备时，需要考虑设备的尺寸、功能、质量和价格等因素。

6. 安全问题：卫生间需要考虑安全问题，如安装防滑地面、设置安全扶手、选用安全电器等。

总之，农村简约三层装修的卫生间设计需要综合考虑空间布局、地面和墙面、通风和采光、给排水、浴室设备和安全问题等多个方面，以确保卫生间的实用性、舒适性和安全性。