对于农村二层自建房翻新，需要考虑以下几个隔音问题：

1. 外墙隔音：外墙是住宅与外界接触的主要部分，容易受到外界噪音的干扰。在翻新时，可以使用隔音材料来增强外墙的隔音效果，例如安装隔音板、使用吸音材料等。

2. 窗户隔音：窗户是住宅中噪音进入的主要通道之一。在翻新时，可以选择隔音性能较好的窗户材料，例如中空玻璃、多层玻璃等，同时也可以安装窗户隔音条来提高窗户的隔音效果。

3. 地板隔音：在二层自建房中，地板也是噪音传播的重要途径之一。在翻新时，可以使用隔音地板、地毯等材料来降低噪音的传播。

4. 天花板隔音：天花板也是噪音传播的重要途径之一。在翻新时，可以使用隔音吊顶、隔音板等材料来降低噪音的传播。

5. 管道隔音：管道也是噪音传播的重要途径之一。在翻新时，可以对管道进行隔音处理，例如包裹隔音材料、安装隔音罩等。

6. 门的隔音：门是住宅中噪音进入的另一个主要通道。在翻新时，可以选择隔音性能较好的门材料，例如实木门、复合门等，同时也可以安装门隔音条来提高门的隔音效果。

7. 室内装修材料的选择：在室内装修中，选择隔音性能较好的装修材料也可以有效降低噪音的传播。例如，使用隔音板、吸音材料等。

综上所述，农村二层自建房翻新需要全面考虑隔音问题，选择合适的隔音材料和装修方案，以提高住宅的隔音效果，为住户提供一个安静、舒适的居住环境。