农村自建房三层的墙面材料有很多选择，以下是一些常见的墙面材料：

1. 涂料：涂料是一种简单、方便的墙面材料，可以选择不同的颜色和光泽度。涂料的优点是价格便宜、施工简单，而且可以快速干燥。但是涂料的耐久性和防水性相对较差，容易受到损坏和污染。

2. 壁纸：壁纸是一种美观、多样的墙面材料，可以选择不同的图案和颜色。壁纸的优点是美观、温馨，而且施工相对简单。但是壁纸的耐久性和防水性相对较差，容易受到损坏和污染，而且壁纸的价格相对较高。

3. 瓷砖：瓷砖是一种耐用、防水的墙面材料，可以选择不同的颜色和纹理。瓷砖的优点是耐用、防水、易清洁，而且施工相对简单。但是瓷砖的价格相对较高，施工难度较大，而且瓷砖的质感相对较冷硬。

4. 石材：石材是一种高贵、豪华的墙面材料，可以选择不同的颜色和纹理。石材的优点是耐用、防水、高贵、豪华，但是石材的价格相对较高，施工难度较大，而且石材的重量较大，需要考虑承重问题。

5. 木板：木板是一种自然、温馨的墙面材料，可以选择不同的颜色和纹理。木板的优点是自然、温馨、舒适，但是木板的耐久性和防水性相对较差，容易受到损坏和污染，而且木板的价格相对较高。

以上是一些常见的农村自建房三层的墙面材料，不同的材料有不同的优缺点，需要根据自己的需求和预算选择合适的材料。同时，墙面材料的选择还需要考虑到与整个家居风格的搭配，以达到美观、实用的效果。