农村二层挑空别墅的卫生间设计需要考虑以下几个方面：

一、布局

1. 卫生间的数量：根据别墅的居住人数和使用需求，确定卫生间的数量。通常情况下，至少需要设计两个卫生间，分别位于一层和二层。

2. 卫生间的位置：卫生间应该位于方便使用的位置，例如靠近卧室、厨房或楼梯。同时，卫生间的位置也应该避免与餐厅、客厅等公共区域相邻，以保证卫生和私密性。

3. 卫生间的内部布局：卫生间的内部布局应该合理，充分考虑使用需求。通常情况下，卫生间需要配置洗手池、马桶、淋浴间或浴缸、洗衣机等设施。洗手池和马桶应该分隔开，淋浴间或浴缸应该与洗手池和马桶分开，以保证使用的便利性和卫生。

二、排水系统

卫生间的排水系统非常重要，需要考虑排水的顺畅性和防止渗漏。在设计卫生间时，需要考虑排水管道的铺设位置和方式，以及管道的材质和口径。建议采用优质的排水管道，并做好排水管道的保护措施，以防止管道损坏和渗漏。

三、通风系统

卫生间需要良好的通风，以保持空气的流通和干燥。在设计卫生间时，需要考虑通风管道的铺设位置和方式，以及通风设备的选择。建议采用强制通风系统，以保证卫生间的空气质量和舒适度。

四、防水

卫生间是用水较多的区域，需要做好防水措施，以防止渗漏。在设计卫生间时，需要考虑地面和墙面的防水处理，建议采用防水涂料和防水瓷砖等防水材料。同时，卫生间的排水系统也需要做好防水处理，以防止渗漏。

五、电路

卫生间需要铺设电路，以满足相关设备的用电需求。在设计卫生间时，需要考虑电路的铺设位置和方式，以及电路的安全性能。建议采用优质的电线和电器设备，并做好电路的保护措施，以防止电路故障和安全事故。

六、装修材料

卫生间的装修材料应该选择防水、防滑、易清洁的材料，例如瓷砖、防水涂料等。同时，装修材料的颜色和风格也应该与别墅的整体装修风格相协调。

总之，农村二层挑空别墅的卫生间设计需要综合考虑布局、排水系统、通风系统、防水、电路和装修材料等多个方面，以确保卫生间的使用舒适度和安全性。